Parmi les moyens alternatifs de protection des plantes, la lutte contre les micro-organismes phytopathogènes utilise des micro-organismes antagonistes comme agents de lutte biologique.
Les modes d'action de ces agents sont l'antibiose, l'hyperparasitisme, la compétition, l'interférence avec le pouvoir pathogène des agents infectieux et l'induction de résistance chez les plantes hôtes ; un agent peut réunir plusieurs mécanismes. La plupart ont un spectre d'action limité, ce qui freine leur autorisation comme produits de protection des plantes. Pour tous, se pose la question du recours au génie génétique (micro-organismes génétiquement modifiés ou plantes génétiquement modifées avec leurs gènes).
Contre les pathogènes dits du sol ou telluriques, les micro-organismes utiles sont des antagonistes naturels isolés à partir de sols. Une soixantaine d'agents sont vendus dans le monde comme fongicides ou stimulants de croissance. Une vingtaine sont des bactéries et une trentaine des champignons ; un seul est autorisé comme bio-fongicide en France.
Une dizaine de micro-organismes sont autorisés dans le monde contre des maladies des parties aériennes (aucun en France). Ces maladies « aériennes », polycycliques, sont explosives et les plantes-hôtes sont un environnement hostile : l'avenir passe donc par des agents plus adaptés (« compétence écologique »), des formulations les protégeant et de meilleures conditions d'application.
Contre les pathogènes de post-récolte, les agents de lutte biologique sont testés surtout sur fruits. Divers champignons et bactéries sont autorisés dans le monde (aucun en France). Ils ont un bel avenir, probablement associés à d'autres méthodes, conventionnelles (fongicides chimiques, cires) ou alternatives, dans un cadre de protection intégrée. Among the alternative plant protection methods, antagonist micro-organisms are used to control phytopathogenic micro-organisms. The modes of action of these agents include antibiosis, hyperparasitism, competition, interference with the pathogenic capability of infectious agents and induction of resistance in host plants. Genetic engineering (GMOs) is a key issue.
For control of telluric pathogens, antagonist micro-organisms selected from natural soils are the most useful. Around sixty agents are currently available worldwide as fungicides or growth stimulants. Twenty or so are bacteria and thirty or so are fungi.
Ten micro-organisms are currently authorised for the control of aerial diseases in the world, but not in France. Future development will require research about ecological competence of agents, protectant formulations and better application conditions.
For the control of post-harvest diseases, trials of biological control agents are ongoing, especially on fruit. Bacteria and fungi represent an excellent development area, probably in association with other conventional (chemical fungicides, wax) or alternative methods, in integrated pest management.



