La transition agroécologique complexifie considérablement la protection des cultures. De nombreuses alternatives aux pesticides sont proposées ou à l'étude actuellement mais aucune ne remplace à elle seule l'efficacité d'un pesticide. L'enjeu est de les combiner en jouant sur leur complémentarité. Aux côtés de moyens agissant directement sur les bioagresseurs, figurent des alternatives visant à optimiser l'immunité végétale, notamment la résistance variétale et l'utilisation de stimulateurs de défenses des plantes (SDP).
Mais améliorer l'immunité de la culture implique probablement des compromis, que ce soit en sélection variétale ou en pratiques culturales, afin de concilier système immunitaire à spectre d'action étendu, productivité et qualité organoleptique des produits agricoles.
