Les mycotoxines sont des substances chimiques toxiques pour les hommes et les animaux, présentes dans les denrées végétales, principalement excrétées ou produites par des champignons des genres Aspergillus, Penicillium, Fusarium ou Claviceps.
Les moyens de gestion font appel à la lutte « directe », via la sélection variétale, et le contrôle des insectes vecteurs facilitant la dissémination des champignons toxinogènes, ou des adventices hôtes ou toxiques. Des méthodes indirectes (rotations adaptées, dates de semis et de récolte précoces, enfouissement profond des résidus de culture, prévention des différents stress abiotiques) sont mises en oeuvre en parallèle. La gestion des lots en fonction de leur finalité (alimentation humaine, alimentation animale, produits industriels, fermenteurs, enfouissement sans valorisation) reste un dernier recours dans les pays au PIB élevé.
