La fusariose de l'épi est une maladie du blé induite par un complexe de plusieurs espèces de champignons des genres Fusarium et Microdochium, aux caractères épidémiologiques différents, productrices ou non de toxines. Les fongicides actuellement sur le marché ont des efficacités différentes selon les espèces, et des résistances sélectionnées par certaines substances limitent l'efficacité de cette méthode de lutte. Dans un objectif de réduction des pesticides, la lutte prophylactique devient un enjeu majeur et passe par une meilleure compréhension de l'épidémiologie des espèces en présence.
Trois ans de travaux menés dans le cadre du projet EcoFusa ont visé à mieux caractériser la source d'inoculum de Fusarium graminearum, espèce dominante productrice de déoxynivalénol (DON), et de deux espèces de Microdochium, M. nivale et M. majus.
Les résultats obtenus confirment que les résidus en surface sont la source majeure d'inoculum de F. graminearum et que la composition et la quantité de ces résidus (donc leur gestion) peuvent moduler fortement cet inoculum en cours de campagne avec un effet sur la qualité sanitaire des blés récoltés (taux de DON). En revanche, les deux espèces de Microdochium ne sont pas impactées par les pratiques agronomiques et l'origine de leur inoculum reste inconnue.
