Les conditions rencontrées par la semence au cours de sa formation sur le porte-graine et les pratiques culturales mises en oeuvre restent déterminantes pour obtenir un lot de haute qualité. La protection des cultures joue là un rôle de tout premier plan.
La maîtrise du rendement en semences est le premier enjeu auquel sont confrontés agriculteurs-multiplicateurs et entreprises semencières. Certaines cultures porte-graines comme le trèfle violet ou le radis sont actuellement en difficulté en France du fait de l'impossibilité de maîtriser des ravageurs à fort impact sur le rendement. Par ailleurs, le contrôle des adventices dans la parcelle de multiplication est essentiel pour maîtriser la pureté spécifique du lot et fournir aux utilisateurs des semences indemnes ou à des taux infimes de graines d'adventices. La protection des cultures porte-graines peut également être déterminante pour se protéger de bioagresseurs à l'origine de défauts de germination, comme dans le cas des fusarioses sur céréales, ou des bruches sur légumineuses. L'enjeu est enfin de limiter le risque de propagation de maladies. Mais ce sont les ravageurs qui posent aujourd'hui le plus de difficultés, avec comme conséquences de fortes baisses des surfaces de multiplication pour certaines espèces.
