Les virus des mosaïques transmis aux céréales par Polymyxa graminis

Parmi dix virus transmis par Polymyxa graminis décrits dans le monde sur le blé, l'orge, l'avoine et le seigle, huit sont identifiés en France.
Par l'importance des surfaces contaminées le virus de la mosaïque jaune de l'orge (BaYMV-VMJO) et le virus de la mosaïque modérée de l'orge (BaMMV-VMMO) constituent actuellement le problème majeur notamment chez l'orge brassicole, d'autant qu'on ne connaît pas de variétés résistantes à l'ensemble des pathotypes de ces virus.
Depuis trois ans, de nouveaux pathotypes du BaYMV, du BaMMV ainsi qu'un nouveau virus en bâtonnet ont été identifiés sur l'orge en France. Le nouveau pathotype de BaYMV avait été identifié sur l'orge brassicole Esterel dès 2001 dans la Marne en association avec un virus en bâtonnet. Ce pathotype, détecté dans plus de 15 parcelles en 2004, se distingue du BaYMV-2 au champ par la présence de symptômes de mosaïque et des foyers nanifiés jusqu'à l'épiaison.
Dans le même temps, de nouveaux gènes de résistance aux mosaïques de l'orge ont été décrits et on en recense maintenant quinze. Les outils de marquage moléculaires ont progressé, ce qui permet de faciliter la sélection de variétés combinant plusieurs gènes pour une résistance plus durable.
Sur blé, le virus de la mosaïque du blé décrit dans divers pays européens et le virus de la mosaïque du seigle décrit en Allemagne sont considérés aujourd'hui comme une entité pathologique identique avec comme nom virus de la mosaïque des céréales (SBCMV-VMC). Le blé, le seigle et le triticale sont des hôtes d'importance agronomique de ce virus. Des comparaisons de séquences des bymovirus du blé (Virus de la mosaïque jaune du blé - WYMV) avec celui décrit au Canada (Virus de la mosaïque striée en fuseaux du blé - WSSMV) ont rapproché les isolats européens et américains et le terme de WSSMV est retenu pour ce virus en France.
Malgré la culture de nombreuses variétés de blé résistantes aux SBCMV et WSSMV, des problèmes subsistent en raison de l'apparition d'un nouveau virus dans l'Aube (Virus de la mosaïque de l'Aube-AWMV), de la présence du SBWMV en France et en Allemagne et de la découverte d'un variant sérologique du WSSMV en France (WSSMV-sII).
Pour l'ensemble de ces virus, une nette extension est observée lors de la campagne 2003-2004. On notera en particulier l'infection plus fréquente du blé dur par le WSSMV en Beauce.
En raison du fort potentiel de variabilité des virus transmis aux céréales par Polymyxa et du maintien probable de la majorité de ces virus dans les parties racinaires des variétés dites résistantes, l'effort consenti ces dernières années par l'amélioration des plantes sur ces espèces doit être poursuivi. Of the several viruses of wheat, barley, oats, and rye transmitted by Polymyxa graminis that have been reported in the world, eight have been identified in France. Barley yellow mosaic virus (BaYMV-VMJO) and barley mild mosaic virus (BaMMV-VMMO) constitute the major problem because of the area of land contaminated and also because of the absence of crop varieties resistant to all of the pathotypes of these viruses. In the last three years, new pathotypes of BaYMV and BaMMV as well as a new furo-like virus in barley have been identified in France. The new pathotype of BaYMV was detected in 2001 in the Marne area on the malting barley variety Esterel in mixture with a furo-like virus. This pathotype, spread on more than 15 fields in 2004, is distinguished from BaYMV-2 by the persistence of its foliar symptoms and the presence of stunted plants up until earing. At the same time, new resistance genes to barley mosaic viruses have been identified and now 15 genes are characterized. Molecular tools have also improved and they offer the possibility to combine resistance genes in the same cultivar to create more stable resistance. Soil-borne wheat mosaic virus, described in several European countries, and soil-borne rye mosaic virus, described in Germany, are now considered identical pathogens and are called Soil-borne cereal mosaic virus (SBCMV-VMC). This virus infects wheat, rye and triticale. Comparisons of the sequences of the bymovirus of wheat in France (Wheat yellow mosaic virus WYMV-VMJB) with that described in Canada (Wheat spindle streak mosaic virus WSSMV-VSFB) showed the similarity of the European isolates to the American isolates and the term WSSMV is retained for this virus detected in France. Although many wheat cultivars are tolerant/resistant to SBCMV and WSSMV, there are concerns about the appearance of a new virus in wheat (AWMV), the discovery of SBWMV in France and Germany and a serological variant of WSSMV in France. For all of these viruses a clear extension was observed during the 2003-2004 season particularly in durum wheat in the Beauce region infected with WSSMV.
Because of the great potential variability of the viruses transmitted by Polymyxa and the probable maintainence of most of these viruses within roots of varieties termed resistant, the planned effort of recent years to improve these species needs to be continued.