Une analyse microbiologique a été réalisée en 1997 et 1998 sur une centaine de lots de blé (épis et grains). Elle a montré la présence d'une microflore fongique très variée.
Plusieurs champignons saprophytes sont fréquemment rencontrés. Aucun n'est connu comme toxinogène, c'est-à-dire ayant la capacité de produire des mycotoxines dangereuses pour les animaux et l'homme. Certains peuvent avoir une activité antagoniste intéressante vis-à-vis de champignons phytopathogènes.
Parmi les pathogènes présents, Botrytis spp. et Key words : wheat, quality, mycological survey, saprophyte, pathogen, antagonistic, toxigenic, mycotoxins, Fusarium spp., Microdochium nivale, Cladosporium spp., Alternaria spp., Epicoccum purpurscens, Rhizopus spp., Penicillium spp. Leptosphaeria nodorum (an. Septoria nodorum) peuvent affecter le rendement et la qualité germinative des grains, mais ne sont pas connus comme toxinogènes.
D'autres sont connus comme potentiellement toxinogènes : Key words : wheat, quality, mycological survey, saprophyte, pathogen, antagonistic, toxigenic, mycotoxins, Fusarium spp., Microdochium nivale, Cladosporium spp., Alternaria spp., Epicoccum purpurscens, Rhizopus spp., Penicillium spp. Fusarium spp. (présents sur la majorité des lots) et Key words : wheat, quality, mycological survey, saprophyte, pathogen, antagonistic, toxigenic, mycotoxins, Fusarium spp., Microdochium nivale, Cladosporium spp., Alternaria spp., Epicoccum purpurscens, Rhizopus spp., Penicillium spp. Microdochium nivale (plus de 20 % des lots). Certains parasites secondaires rencontrés Key words : wheat, quality, mycological survey, saprophyte, pathogen, antagonistic, toxigenic, mycotoxins, Fusarium spp., Microdochium nivale, Cladosporium spp., Alternaria spp., Epicoccum purpurscens, Rhizopus spp., Penicillium spp. (Cladosporium spp., Alternaria spp., Epicoccum purpurascens et Rhizopus spp.) peuvent produire des mycotoxines in vitro , mais leur capacité de synthèse de mycotoxines in vivo n'a jamais été évaluée. Les Penicillium spp . (parasites de stockage rencontrés dans certains lots) sont également connus comme toxinogènes.
Pour un suivi sanitaire efficace, il serait souhaitable de rechercher spécifiquement les espèces toxinogènes à l'aide de méthodes moléculaires ciblées, mais aussi d'évaluer la capacité de production de mycotoxines in vivo d'espèces et genres repérés comme toxinogènes in vitro .
Various fungis, a few a them are bad for quality
In 1997 and 1998, a microbiological survey has been carried out in France, on several hundred wheat samples (ears and grains). The study has revealed a wide range of fungal diversity at the surface of ear and grain.
Several saprophytes are frequently reported. No one is toxinogen (which can produce harmful mycotoxins for animals and men). Some of them can exhibit interesting antagonistic properties against pathogens.
Among the pathogens detected, Botrytis spp. and Leptosphaeria nodorum (anamorph : Septoria nodorum ) decrease yield and also the germinal faculty of seeds, but they are not toxinogens. Other species are potentially toxinogens : Fusarium spp. (identified in a big part of the samples), Microdochium nivale (more than 20 % of the samples). Some of the secondary pathogens frequently detected in ears and grains ( Cladosporium spp., Alternaria spp., Epicoccum purpurascens and Rhizopus spp.), can produce mycotoxins in vitro , but their capacity to produce them in vivo is not known. The Penicillium spp. (post-harvested pathogens detected in severals samples) are also known as potent toxigenic fungi.
For an efficient quality control, it would be better to detect specifically only the toxigenic fungi. Development of molecular tools such as DNA specific probes appear to be the most suitable technique to achieve this goal.
