Dans le but de détecter Phytophthora fragariae var. rubi et var fragariae , pathogènes respectivement sur framboisier et sur fraisier, assez précocement pour pouvoir éliminer les plants malades en pépinières et éviter ainsi la propagation de la maladie, des essais d'utilisation de méthodes de biologie moléculaire ont été menés au LRPV de Bordeaux avec divers partenaires.
Une mycothèque d'isolats de Phytophthora fragariae var. rubi a été constituée. 28 isolats d'origine française, dont 23 collectés spécialement sur le terrain et 5 provenant d'une mycothèque écossaise, ont pu être rassemblés.
Ensuite on a recherché des amorces spécifiques pour pouvoir pratiquer la PCR en amplifiant des fragments d'ADN ribosomique propres à l'espèce. Après recherche bibliographique puis essais sur des amorces disponibles, toutes ne sont pas spécifiques de l'espèce fragariae , mais deux d'entre d'elles semblent utilisables (sans différencier les deux variétés rubi et fragariae ).
Puis des essais ont été menés pour obtenir une sensibilité suffisante de la méthode. Ils sont encourageants et permettent d'envisager l'usage de ces tests pour un dépistage de routine.
With the aim of achieving early detection of Phytophthora fragariae var. rubi and var. fragariae , pathogenic agents affecting raspberry and strawberry plants respectively, in order to be able to eliminate diseased plants in nurseries and therefore avoid spread of the disease, methods using molecular biology have been carried out by the regional plant protection laboratory (LRPV) of Bordeaux, working in collaboration with a number of partners.
The first step involved the creation of a fungus culture store containing isolates of P. fragariae var. rubi. Of the 28 isolates of French origin collected, 23 were collected on-site, with the remaining 5 coming from a Scottish fungus culture store.
The next step was to find specific triggers in order to be able to carry out a PCR by amplifying fragments of DNA ribosome specific to the species. Following extensive bibliographical studies and tests of the available triggers, it became clear that they are not all specific to the French species ? two of them would however seem to be usuable (without differentiating between the two varieties rubi and fragariae ).
Finally tests were carried out in order to establish a satisfactory sensitivity level for the method. The results are encouraging, and give rise to the hope that such tests could be used in the future for routine detection.
