Les phytoplasmes sont des bactéries qui colonisent la sève élaborée des plantes et provoquent de nombreuses maladies des cultures.
Les phytoplasmes sont transmis selon un mode persistant par des insectes tels que les cicadelles, les fulgores et les psylles, mais aussi par la multiplication végétative de plants infectés. Leur contrôle s'appuie sur la surveillance et l'élimination des plants malades, l'élimination de plantes sauvages réservoirs, la lutte contre l'insecte vecteur s'il est inféodé à la culture et la certification de plants sains. Dans les cultures pérennes, l'augmentation des prospections et le traitement à l'eau chaude des plants sont les meilleurs outils de gestion de ces maladies.
La généralisation des outils de traçabilité génétique des phytoplasmes facilite la compréhension des épidémies. Ainsi, les découvertes récentes sur l'origine de la flavescence dorée de la vigne permettent de moduler la lutte insecticide contre les vecteurs en ne traitant plus les cas non épidémiques émergeant de réservoirs naturels comme les aulnes. Les recherches actuelles tentent de décrypter à la fois les mécanismes de transmission par leurs insectes vecteurs, mais aussi ceux de la perturbation du métabolisme et du développement de leurs plantes-hôtes. Ces avancées permettraient de mieux prédire et ralentir les épidémies, et de sélectionner des variétés plus résistantes.
