La surveillance phytosanitaire doit permettre la détection précoce d'organismes nuisibles pour mettre en place une gestion pertinente d'éradication ou de contrôle des populations et ainsi sécuriser la production agricole française, mais également les exportations de végétaux ou produits végétaux vers les pays tiers.
La surveillance biologique du territoire (SBT) vise à s'assurer de l'état sanitaire des végétaux et produits végétaux et également suivre l'apparition d'éventuels effets non intentionnels (ENI) des pratiques agricoles sur l'environnement. Elle regroupe pour cela plusieurs dispositifs complémentaires de surveillance avec : une surveillance officielle pour les organismes réglementés et émergents ; et une surveillance non officielle pour les organismes non réglementés. Néanmoins, le ministère en charge de l'agriculture est mobilisé dans tous ces types de surveillance à différentes échelles et toutes les parties prenantes de la santé des végétaux sont impliquées au sein de la SBT.